Tento typ masáže sa vykonáva vo vani, usmerňovaným prúdom vody z masážnej hadice. Je to kombinácia vodného kúpeľa pri teplote 36-38 °C a masáže. Tlak vody pri masáži je 1-3 atm. Najvyšší tlak je možné aplikovať na veľké svalové skupiny, najnižší na oblasť brucha, kĺbov a všade tam, kde je kosť blízko pod povrchom kože (napr. predkolenie). Masáž pôsobí predovšetkým na uvoľnenie stuhnutosti svalov a spojivových tkanív, zmiernenie bolesti a čiastočné uvoľnenie kĺbov. Subaquálna masáž môže byť poskytovaná aj v hydromasážnej vani, kde je aplikovaná pomocou zostavy väčšieho počtu trysiek.